More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15300 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 406 aa  802    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  52.74 
 
 		 358 aa  332  9e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  55.86 
 
 		 330 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  49.86 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  54.83 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  51.21 
 
 		 366 aa  323  5e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  54.6 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  43.46 
 
 		 412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  46.52 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  46.01 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  44.29 
 
 		 338 aa  292  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  49.69 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  46.49 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  43.24 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  47.6 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  42.25 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  47.25 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  45.62 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  49.2 
 
 		 326 aa  256  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  39.6 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  39.6 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  39.6 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  46.01 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  42.7 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  42.64 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  47.13 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  41.64 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  39.61 
 
 		 453 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  41.03 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  44.64 
 
 		 414 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  42.74 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  42.81 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  43.77 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  39.95 
 
 		 442 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  39.47 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  31.64 
 
 		 977 aa  172  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  37.34 
 
 		 900 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  35.74 
 
 		 286 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.57 
 
 		 989 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  33.02 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.82 
 
 		 855 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  35.22 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  31.33 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.16 
 
 		 911 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  35.42 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.73 
 
 		 761 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.23 
 
 		 762 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.91 
 
 		 995 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  36.21 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  32.39 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  33.11 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  36.48 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.99 
 
 		 735 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  36.48 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.63 
 
 		 856 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  30.61 
 
 		 1001 aa  136  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  32.62 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  32.62 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.69 
 
 		 759 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  33.98 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  32.01 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  30.1 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  30.29 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  33.98 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  29.73 
 
 		 323 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  29.61 
 
 		 323 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  32.33 
 
 		 293 aa  133  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.3 
 
 		 740 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  33 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  34.59 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  29.29 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  34.43 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  34.28 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.82 
 
 		 991 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  33.77 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  29.88 
 
 		 323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  29.21 
 
 		 308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  30 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  32.45 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  31.92 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.12 
 
 		 846 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.35 
 
 		 750 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.11 
 
 		 846 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.67 
 
 		 750 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  32.81 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  33.89 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  32.69 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  28.57 
 
 		 280 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  31.83 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  32.08 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  32.06 
 
 		 414 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  32.45 
 
 		 314 aa  126  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  34.69 
 
 		 313 aa  126  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  33.77 
 
 		 301 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  29.69 
 
 		 347 aa  125  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  31.82 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.03 
 
 		 748 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>