More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1696 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 396 aa  790    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  59.25 
 
 		 414 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  56.71 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  49.11 
 
 		 422 aa  352  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  48 
 
 		 417 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  48 
 
 		 417 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  48 
 
 		 417 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  47.49 
 
 		 423 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  47.99 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  45.38 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  47.71 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  42.51 
 
 		 416 aa  299  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  42.89 
 
 		 414 aa  285  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  44.03 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  50.31 
 
 		 453 aa  275  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  48.11 
 
 		 417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  45.3 
 
 		 394 aa  270  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  43.89 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  42.89 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  43.23 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  45.16 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  42.99 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  44.51 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  42.15 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  43.17 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  40.94 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  43.03 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  38.76 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  42.77 
 
 		 326 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  44.97 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  38.4 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  40.72 
 
 		 340 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  39.46 
 
 		 338 aa  223  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  38.84 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  36.91 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.13 
 
 		 989 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.33 
 
 		 977 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  35.53 
 
 		 900 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  33.22 
 
 		 286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  33.77 
 
 		 289 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  33.88 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  33.88 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.87 
 
 		 759 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  33.54 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 303 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  34.13 
 
 		 280 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  36.47 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  32.8 
 
 		 296 aa  146  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.01 
 
 		 855 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  31.49 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  31.49 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  34.92 
 
 		 292 aa  143  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  30.06 
 
 		 761 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.77 
 
 		 740 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  32.81 
 
 		 735 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  30.63 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  33.88 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  31.1 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.77 
 
 		 762 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  29.91 
 
 		 323 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  29.91 
 
 		 323 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  29.91 
 
 		 323 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  29.91 
 
 		 323 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  33.55 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  29.91 
 
 		 323 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  35.45 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 293 aa  136  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  30.22 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  31.11 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  31.11 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  33.68 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  32.37 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  32.46 
 
 		 312 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  31.31 
 
 		 302 aa  133  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  30.45 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  32.68 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  28.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  28.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  28.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  28.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  28.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  28.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  28.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  28.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  28.97 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  29.93 
 
 		 323 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  31.31 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  30.74 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  32.65 
 
 		 308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  29.39 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  30.14 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.1 
 
 		 755 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  29.41 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  29.88 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  32.13 
 
 		 291 aa  127  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  32.77 
 
 		 338 aa  127  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  31.71 
 
 		 318 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  29.68 
 
 		 298 aa  126  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  30.89 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>