More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 364 aa  721    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  56 
 
 		 360 aa  355  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  51.26 
 
 		 358 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  52.66 
 
 		 371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  49.55 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  48.47 
 
 		 340 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  47.9 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  49.86 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  50.16 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  50.32 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  46.33 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  41.69 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  43.44 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  46.82 
 
 		 417 aa  252  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  41.23 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  44.05 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  37.34 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  37.34 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  37.34 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  38.97 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  41.53 
 
 		 442 aa  235  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  39.73 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  40.06 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  41.49 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  40.24 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  42.86 
 
 		 398 aa  229  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  46 
 
 		 326 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  40.53 
 
 		 414 aa  222  9e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  42.86 
 
 		 453 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  36.9 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  37.86 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  38.86 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  37.89 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  39 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  38.72 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.01 
 
 		 977 aa  155  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.62 
 
 		 989 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  31.94 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  33.69 
 
 		 855 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  32.88 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  29.13 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  33.44 
 
 		 900 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.29 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  32.24 
 
 		 296 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  32.78 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.62 
 
 		 991 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  32.54 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  32.38 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.42 
 
 		 735 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  30.77 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  34.41 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  28.81 
 
 		 289 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  32.62 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  31.21 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  30.56 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  27.42 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  34.83 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  29.43 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  27.21 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  34.83 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  32.31 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  30.82 
 
 		 740 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  34.51 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  27.99 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.55 
 
 		 856 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  30.41 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  30.22 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  30.72 
 
 		 320 aa  116  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  30 
 
 		 761 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  29.02 
 
 		 759 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.77 
 
 		 762 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  32.06 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  30.56 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  31.25 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  32.75 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  32.75 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  29.39 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  30.07 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.9 
 
 		 1055 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.75 
 
 		 911 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  29.1 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  30.47 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0871  preprotein translocase subunit SecF  28.97 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  30.77 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  29.63 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.92 
 
 		 995 aa  109  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  30.41 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  30.42 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  28.95 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  30.27 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  26.14 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  29.59 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.83 
 
 		 991 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  29.25 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  30.57 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  29.08 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  28.01 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10111  preprotein translocase subunit SecF  27.04 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>