More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_12850 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  100 
 
 
346 aa  681    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  57.82 
 
 
338 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  59.26 
 
 
340 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  51.89 
 
 
358 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  49.07 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  51.89 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  51.78 
 
 
371 aa  295  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  46.33 
 
 
364 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  48.62 
 
 
330 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  44.82 
 
 
414 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  49.21 
 
 
363 aa  278  9e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  46.13 
 
 
406 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  41.92 
 
 
412 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  42.95 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  40.58 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  45.42 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  40.42 
 
 
417 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  41.19 
 
 
416 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  39.88 
 
 
390 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  41.94 
 
 
398 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  41.02 
 
 
394 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  42.2 
 
 
394 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  38.74 
 
 
422 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 
417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 
417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 
417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  38.48 
 
 
421 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  40.24 
 
 
414 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  37.03 
 
 
423 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  41.64 
 
 
453 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  36.39 
 
 
432 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  39.44 
 
 
442 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  36.92 
 
 
396 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  36.17 
 
 
374 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  36.2 
 
 
349 aa  187  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.78 
 
 
977 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  29.57 
 
 
989 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  33.44 
 
 
855 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  35.07 
 
 
292 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  34.35 
 
 
900 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.87 
 
 
740 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  32.03 
 
 
296 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  33.11 
 
 
308 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  26.58 
 
 
289 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  28.96 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  30.74 
 
 
759 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  29.61 
 
 
307 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  26.5 
 
 
308 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  28.83 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.25 
 
 
911 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  30.18 
 
 
761 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  26.64 
 
 
289 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.19 
 
 
762 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  26.24 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  31.66 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  29.28 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  30.56 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  30.21 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  26.61 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  27.11 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  28.08 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  26.88 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  30.74 
 
 
291 aa  110  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  28.06 
 
 
291 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  29.02 
 
 
302 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.97 
 
 
991 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  31.36 
 
 
357 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  28.53 
 
 
304 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.24 
 
 
750 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  26.51 
 
 
849 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  29.31 
 
 
307 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  29.28 
 
 
304 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.77 
 
 
759 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  29.32 
 
 
293 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  27.6 
 
 
310 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  36.26 
 
 
359 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  28.87 
 
 
302 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  30.97 
 
 
311 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.77 
 
 
759 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.77 
 
 
759 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  32.37 
 
 
311 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  30.74 
 
 
315 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.92 
 
 
785 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  31.02 
 
 
301 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  28.26 
 
 
311 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.92 
 
 
785 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27 
 
 
763 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.59 
 
 
995 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.36 
 
 
856 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  28.94 
 
 
336 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  26.79 
 
 
316 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  26.32 
 
 
323 aa  100  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  28.57 
 
 
315 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  27.65 
 
 
291 aa  100  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.77 
 
 
750 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  30.27 
 
 
314 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  27.01 
 
 
307 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  28.78 
 
 
310 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  24.48 
 
 
305 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  24.48 
 
 
305 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>