More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1335 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 292 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  38.14 
 
 		 414 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  44.01 
 
 		 989 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  39.16 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  37.41 
 
 		 286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  38.51 
 
 		 416 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  37.58 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  39.5 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  35.59 
 
 		 412 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 		 322 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  37.63 
 
 		 900 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  36.64 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  38.51 
 
 		 422 aa  175  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  38.36 
 
 		 423 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  36.95 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  34.46 
 
 		 330 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  34.27 
 
 		 761 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.62 
 
 		 977 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  36.64 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  34.59 
 
 		 347 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  37.24 
 
 		 358 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  38.72 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  36.75 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.19 
 
 		 762 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  33.45 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  35.44 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  35.99 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 417 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 417 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  37.17 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 417 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  36.36 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  36.33 
 
 		 421 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.53 
 
 		 735 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  35.5 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  36.08 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  35.76 
 
 		 442 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.1 
 
 		 755 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.63 
 
 		 754 aa  161  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.63 
 
 		 754 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.63 
 
 		 754 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.63 
 
 		 754 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.62 
 
 		 752 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.63 
 
 		 754 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.63 
 
 		 754 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.63 
 
 		 750 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.93 
 
 		 754 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.93 
 
 		 754 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  33.23 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.28 
 
 		 754 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  33.9 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  34.03 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.14 
 
 		 759 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.68 
 
 		 750 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  37.19 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36.19 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  37.54 
 
 		 453 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  31.83 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  31.35 
 
 		 328 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  34.47 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36.19 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  35.05 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0673  preprotein translocase subunit SecF  31.93 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.392414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  38.28 
 
 		 855 aa  156  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  34.92 
 
 		 396 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  37.02 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  30.14 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  34.88 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  32.46 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  33.9 
 
 		 740 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  29.67 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  34.01 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  33.7 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  32.74 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  35.12 
 
 		 414 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.91 
 
 		 911 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  36.21 
 
 		 406 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  34.97 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  36.29 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  35.91 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  34.03 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 394 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  34.12 
 
 		 849 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  34.88 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  34.72 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  34.36 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  38.13 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  42.51 
 
 		 400 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1310  protein-export membrane protein SecF  40.1 
 
 		 402 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1411  protein-export membrane protein SecF  40.1 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  30.45 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  32.77 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  34.8 
 
 		 326 aa  148  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>