More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1813 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  93.78 
 
 		 394 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 394 aa  772    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  45.13 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  45.1 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  45.9 
 
 		 421 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  47.63 
 
 		 414 aa  300  4e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  49.53 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  45.31 
 
 		 347 aa  289  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  43.89 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  44.37 
 
 		 453 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  43.07 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  40.81 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  40.81 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  40.81 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  39.17 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  40.64 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  43.28 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  44.15 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  46.87 
 
 		 414 aa  275  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  39.11 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  40.41 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  44.14 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  42.82 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  43.58 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  46.5 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  45.91 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  39.15 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  38.73 
 
 		 412 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  45.94 
 
 		 360 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  44.83 
 
 		 326 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  38.26 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  40.55 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  39 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  41.74 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  39.32 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.89 
 
 		 977 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  34.03 
 
 		 900 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  38.75 
 
 		 855 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  31.49 
 
 		 989 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  27.6 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.25 
 
 		 759 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  33.33 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  27.4 
 
 		 286 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  30.67 
 
 		 296 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  29.29 
 
 		 280 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  31.19 
 
 		 740 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.89 
 
 		 911 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  28.3 
 
 		 289 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.97 
 
 		 762 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  26.75 
 
 		 310 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  27.33 
 
 		 289 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  26.62 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  27.24 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  27.21 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  26.21 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  27.01 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.97 
 
 		 763 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  28.95 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.45 
 
 		 759 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  26.58 
 
 		 735 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.45 
 
 		 759 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  25 
 
 		 761 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  29.37 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  28.34 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  25.23 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  25.81 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  26.62 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.24 
 
 		 750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  28.09 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.76 
 
 		 750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  27.07 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  29.26 
 
 		 885 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  27.17 
 
 		 307 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30 
 
 		 856 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  28.53 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  30.1 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  30.16 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  25.55 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  29.33 
 
 		 303 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  30.16 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  28.16 
 
 		 302 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.79 
 
 		 785 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.79 
 
 		 785 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  30 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  28.15 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  29 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  27.42 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  29.9 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  30.31 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  26.44 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.31 
 
 		 759 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.96 
 
 		 846 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  31.25 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  26.45 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  31.16 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  26.33 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  24.92 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  25.48 
 
 		 302 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  29.08 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  26.71 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>