More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 414 aa  840    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  58.75 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  52.53 
 
 		 417 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  52.53 
 
 		 417 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  52.53 
 
 		 417 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  51.36 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  51 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  48.06 
 
 		 442 aa  361  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  46.98 
 
 		 421 aa  329  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  49.85 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  50.3 
 
 		 432 aa  311  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  40.88 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  46.97 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  43.21 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  44.15 
 
 		 398 aa  272  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  46.54 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  44.32 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  42.49 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  44.79 
 
 		 366 aa  269  7e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  42.86 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  43.49 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  44 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  46.37 
 
 		 417 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  39.58 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  39.11 
 
 		 389 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  42.24 
 
 		 347 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  41.83 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  44.24 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  39.76 
 
 		 338 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  45.03 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  45.79 
 
 		 326 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  40.61 
 
 		 364 aa  236  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  40.73 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  38.05 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  39.62 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.42 
 
 		 977 aa  190  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  37.18 
 
 		 900 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.92 
 
 		 989 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.1 
 
 		 855 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  32.78 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  32.8 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  31.09 
 
 		 303 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  35.12 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.8 
 
 		 761 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  31.94 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  32.49 
 
 		 310 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  31.06 
 
 		 289 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  30.38 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.36 
 
 		 740 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.23 
 
 		 750 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  31.9 
 
 		 310 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  32.5 
 
 		 322 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  34.77 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  30.93 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  32.08 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  29.3 
 
 		 304 aa  129  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  29.3 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  26.76 
 
 		 280 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.84 
 
 		 750 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  30.61 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  30.25 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.72 
 
 		 759 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  41.01 
 
 		 359 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.31 
 
 		 856 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  30.65 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.93 
 
 		 911 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.07 
 
 		 762 aa  124  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  32.15 
 
 		 323 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  29.97 
 
 		 318 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  29.68 
 
 		 292 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  29.39 
 
 		 735 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  32.15 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  28.35 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  32.15 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  29.51 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  28.35 
 
 		 305 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  29.82 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  28.7 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  29.54 
 
 		 302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  28.16 
 
 		 310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  30.74 
 
 		 293 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  29.97 
 
 		 322 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  32.89 
 
 		 314 aa  120  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  29.58 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  27.02 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  29.17 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  28.74 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  30.7 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  28.74 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  28.74 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  28.74 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  30.08 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  28.74 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0673  preprotein translocase subunit SecF  26.28 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.392414  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  31.45 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.17 
 
 		 754 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  28.75 
 
 		 298 aa  116  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  28.9 
 
 		 315 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  29.17 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  29.17 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>