More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2299 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  89.91 
 
 		 585 aa  1027    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 585 aa  1176    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  61.24 
 
 		 620 aa  637    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  50.24 
 
 		 714 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  50.66 
 
 		 620 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  51.88 
 
 		 606 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  50.73 
 
 		 635 aa  508  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  46.91 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  55.37 
 
 		 670 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  47.44 
 
 		 684 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  51.96 
 
 		 640 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  41.75 
 
 		 584 aa  360  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  40.97 
 
 		 581 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  39.17 
 
 		 564 aa  351  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  40.38 
 
 		 547 aa  339  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  48.03 
 
 		 674 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  38.2 
 
 		 566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  46.3 
 
 		 605 aa  295  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  38.9 
 
 		 538 aa  287  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  37.29 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  42.74 
 
 		 607 aa  279  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  39.49 
 
 		 666 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  41.19 
 
 		 680 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  43.62 
 
 		 603 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  41.57 
 
 		 653 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  40.27 
 
 		 656 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  44.51 
 
 		 617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  44.44 
 
 		 599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  33.58 
 
 		 496 aa  233  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  45.48 
 
 		 649 aa  231  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  44.61 
 
 		 573 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  41.87 
 
 		 632 aa  219  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  44.14 
 
 		 598 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  44.14 
 
 		 598 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  44.14 
 
 		 598 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  31.21 
 
 		 900 aa  191  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  31.91 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.39 
 
 		 848 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  31.88 
 
 		 470 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  31.88 
 
 		 470 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  29.96 
 
 		 461 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  30.35 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  30.74 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  29.16 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  28.51 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  28.66 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.57 
 
 		 977 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.22 
 
 		 911 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  30.91 
 
 		 855 aa  171  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.45 
 
 		 853 aa  170  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  30.59 
 
 		 531 aa  170  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  29.03 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  30.62 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.51 
 
 		 849 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  29.68 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  27.42 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  30.04 
 
 		 487 aa  166  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  29.98 
 
 		 470 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  35.71 
 
 		 461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  27.83 
 
 		 489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  27.81 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.9 
 
 		 989 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  28.11 
 
 		 495 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  29.68 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  29.19 
 
 		 495 aa  160  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  28.76 
 
 		 525 aa  160  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  27.8 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  29.32 
 
 		 533 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.14 
 
 		 762 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.23 
 
 		 856 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  34.74 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.55 
 
 		 839 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  29.64 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  27.73 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  28.29 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  28.25 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  29.08 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  27.56 
 
 		 472 aa  155  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  28.47 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  29.66 
 
 		 530 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  28.67 
 
 		 534 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  30.94 
 
 		 530 aa  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  35.21 
 
 		 535 aa  153  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  30.49 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  30.75 
 
 		 532 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.21 
 
 		 844 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  36.03 
 
 		 531 aa  151  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  31.41 
 
 		 533 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  26 
 
 		 496 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  33.82 
 
 		 531 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  26.76 
 
 		 496 aa  150  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  28.6 
 
 		 594 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  29.21 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  30.84 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  29.89 
 
 		 735 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  27.03 
 
 		 535 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  28.42 
 
 		 532 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  30.62 
 
 		 532 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  28.36 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  26.83 
 
 		 885 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>