More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1340 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 474 aa  942    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  62.61 
 
 		 477 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  58.64 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  58.09 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  39.38 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  34.6 
 
 		 403 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  37.08 
 
 		 530 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.03 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  33.63 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  35.09 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  35.44 
 
 		 500 aa  217  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  36.78 
 
 		 524 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.95 
 
 		 531 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.35 
 
 		 740 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  35.11 
 
 		 525 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  34.79 
 
 		 533 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  32.48 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  34.11 
 
 		 534 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  33.82 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  31.24 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  32.78 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  32.7 
 
 		 532 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  32.21 
 
 		 530 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 533 aa  209  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.11 
 
 		 853 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.88 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.49 
 
 		 849 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  32.91 
 
 		 532 aa  207  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.17 
 
 		 532 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.92 
 
 		 848 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 533 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  34.92 
 
 		 533 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 531 aa  206  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  32.71 
 
 		 532 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  32.2 
 
 		 532 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  33.84 
 
 		 533 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  35.93 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 532 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  32.69 
 
 		 735 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  32.05 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  33.59 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 843 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  34.66 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  32.31 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  31.74 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  32.7 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  34.1 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  33.11 
 
 		 526 aa  200  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  33.84 
 
 		 535 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  32.15 
 
 		 594 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  32.15 
 
 		 594 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  31.55 
 
 		 554 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  32.1 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  32.52 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  33.18 
 
 		 759 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  31.47 
 
 		 503 aa  196  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  32.02 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  31.77 
 
 		 554 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  32.94 
 
 		 406 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.75 
 
 		 856 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  32.01 
 
 		 533 aa  193  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.42 
 
 		 856 aa  193  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  32.38 
 
 		 556 aa  193  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  32.09 
 
 		 534 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  31.57 
 
 		 625 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  31.76 
 
 		 554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  31.76 
 
 		 554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  32.56 
 
 		 530 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  31.69 
 
 		 473 aa  189  8e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  32.71 
 
 		 411 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  31.01 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  34.72 
 
 		 551 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  30.8 
 
 		 487 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  30.79 
 
 		 554 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  31.45 
 
 		 413 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  40.95 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  31 
 
 		 849 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 616 aa  186  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  33.91 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  30.13 
 
 		 535 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  33.91 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  32.35 
 
 		 609 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  31.2 
 
 		 554 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  30.03 
 
 		 632 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.18 
 
 		 844 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  31.77 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  31.71 
 
 		 632 aa  183  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  32.55 
 
 		 531 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  31.71 
 
 		 632 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  30.18 
 
 		 761 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  30.33 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  31.4 
 
 		 622 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0681  preprotein translocase subunit SecD  30.39 
 
 		 587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  33.67 
 
 		 505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  32.01 
 
 		 510 aa  180  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  34.4 
 
 		 529 aa  180  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.17 
 
 		 762 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.78 
 
 		 839 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  30.8 
 
 		 464 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  30.5 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>