More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1695 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 632 aa  1262    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  53.79 
 
 		 603 aa  608  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  42.04 
 
 		 581 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  50.89 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  61.96 
 
 		 617 aa  379  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  39.29 
 
 		 666 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  39.55 
 
 		 607 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  38.49 
 
 		 653 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  59.94 
 
 		 599 aa  362  8e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  49.77 
 
 		 538 aa  355  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  56.81 
 
 		 598 aa  349  9e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  56.81 
 
 		 598 aa  349  9e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  56.81 
 
 		 598 aa  349  9e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  37.12 
 
 		 714 aa  347  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  39.39 
 
 		 584 aa  343  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  37.82 
 
 		 564 aa  339  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  38.18 
 
 		 670 aa  337  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  51.4 
 
 		 566 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  53.06 
 
 		 649 aa  324  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  52.87 
 
 		 656 aa  321  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  33.66 
 
 		 620 aa  312  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  50.16 
 
 		 680 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  49.73 
 
 		 605 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  35.09 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  42.6 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  44.69 
 
 		 684 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  44.54 
 
 		 635 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  50.19 
 
 		 674 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  34.42 
 
 		 640 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  34.68 
 
 		 547 aa  264  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  41.87 
 
 		 585 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  42.63 
 
 		 620 aa  240  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  41.74 
 
 		 585 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  39.94 
 
 		 496 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  34.57 
 
 		 534 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  36.24 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.68 
 
 		 533 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.31 
 
 		 403 aa  176  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  36.01 
 
 		 533 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  28.4 
 
 		 989 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  37.23 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  38.34 
 
 		 533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  37.68 
 
 		 531 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  35.58 
 
 		 535 aa  174  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  36.49 
 
 		 410 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  36.68 
 
 		 531 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  34.74 
 
 		 413 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  34.94 
 
 		 468 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  32.45 
 
 		 535 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  34.62 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  36.76 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  33.55 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.87 
 
 		 856 aa  163  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  33.44 
 
 		 445 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  32.63 
 
 		 416 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 530 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  33.45 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  32.49 
 
 		 594 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.93 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  32.49 
 
 		 594 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  37.04 
 
 		 622 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  33.11 
 
 		 537 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  34.6 
 
 		 441 aa  161  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.77 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  33.71 
 
 		 1029 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  35.77 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.48 
 
 		 849 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  35.48 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  34.88 
 
 		 761 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  33.92 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  35.07 
 
 		 900 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  33.58 
 
 		 551 aa  157  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  34.83 
 
 		 462 aa  157  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  33.56 
 
 		 406 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  31.43 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 532 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.43 
 
 		 756 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  38.43 
 
 		 740 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  33.73 
 
 		 472 aa  154  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.77 
 
 		 853 aa  154  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  29.14 
 
 		 503 aa  154  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  37.88 
 
 		 533 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  31.82 
 
 		 419 aa  154  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  31.82 
 
 		 419 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  34.09 
 
 		 531 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  32.85 
 
 		 515 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  31.1 
 
 		 554 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  54.73 
 
 		 573 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  32.28 
 
 		 411 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  35.46 
 
 		 605 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  32.54 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  32.96 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.36 
 
 		 995 aa  151  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  34.35 
 
 		 470 aa  152  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  33.7 
 
 		 530 aa  151  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.94 
 
 		 856 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>