More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3816 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 617 aa  1214    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  87.19 
 
 		 599 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  83.57 
 
 		 598 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  83.57 
 
 		 598 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  83.57 
 
 		 598 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  72.97 
 
 		 573 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  50.31 
 
 		 632 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  64.35 
 
 		 603 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  60.41 
 
 		 550 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  60.3 
 
 		 538 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  42.22 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  37.35 
 
 		 666 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  56.39 
 
 		 649 aa  330  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  39.41 
 
 		 584 aa  330  7e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  37.06 
 
 		 714 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  36.6 
 
 		 670 aa  327  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  48.8 
 
 		 680 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  54.86 
 
 		 605 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  48.8 
 
 		 607 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  50.94 
 
 		 656 aa  307  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  47.59 
 
 		 606 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  33.97 
 
 		 564 aa  283  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  39.56 
 
 		 620 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  45.81 
 
 		 635 aa  281  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  45.35 
 
 		 674 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  35.1 
 
 		 640 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  45.32 
 
 		 653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  44.51 
 
 		 585 aa  266  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  47.1 
 
 		 684 aa  263  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  46.84 
 
 		 547 aa  256  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  46.42 
 
 		 620 aa  252  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  43.29 
 
 		 585 aa  246  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  42.86 
 
 		 661 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  42.81 
 
 		 496 aa  211  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  38.27 
 
 		 533 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  40.42 
 
 		 533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  38.91 
 
 		 534 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 532 aa  196  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  39.66 
 
 		 533 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  38.38 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  42.39 
 
 		 531 aa  191  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  36.79 
 
 		 410 aa  188  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  34.67 
 
 		 413 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.36 
 
 		 856 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  37.99 
 
 		 531 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  41.54 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  37.58 
 
 		 535 aa  183  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.17 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.69 
 
 		 848 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  37.24 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  35.82 
 
 		 594 aa  180  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.91 
 
 		 530 aa  180  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  35.82 
 
 		 594 aa  180  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.5 
 
 		 849 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.16 
 
 		 995 aa  179  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  38.41 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 		 554 aa  178  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.56 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.38 
 
 		 856 aa  176  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  35.33 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.55 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  38.08 
 
 		 900 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.14 
 
 		 853 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  37.91 
 
 		 532 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  37.92 
 
 		 537 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  38.81 
 
 		 533 aa  173  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.46 
 
 		 533 aa  173  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.76 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  41.67 
 
 		 533 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  39.45 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  37.68 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  37.94 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  35.8 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 531 aa  171  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  40.97 
 
 		 622 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  36.71 
 
 		 515 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  33.44 
 
 		 416 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  37.28 
 
 		 532 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  38.7 
 
 		 532 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  39.18 
 
 		 487 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  35.46 
 
 		 525 aa  167  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  33.45 
 
 		 419 aa  167  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  33.45 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  33.44 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  33.71 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.69 
 
 		 533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  36.23 
 
 		 530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  38.11 
 
 		 503 aa  164  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  35.34 
 
 		 399 aa  163  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  35.16 
 
 		 989 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.78 
 
 		 839 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  34.93 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  40.23 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  37.72 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.63 
 
 		 855 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  34.51 
 
 		 411 aa  161  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  38.75 
 
 		 533 aa  161  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.97 
 
 		 977 aa  160  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  36.9 
 
 		 735 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>