More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 714 aa  1414    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  58.83 
 
 		 606 aa  637    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  55.43 
 
 		 620 aa  671    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  57.28 
 
 		 670 aa  634  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  49.09 
 
 		 585 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  49.05 
 
 		 684 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  59.7 
 
 		 635 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  48.29 
 
 		 661 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  45.9 
 
 		 640 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  45.64 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  44.14 
 
 		 581 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  44.21 
 
 		 584 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  40.38 
 
 		 564 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  52.02 
 
 		 620 aa  388  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  44.25 
 
 		 547 aa  379  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  38.21 
 
 		 603 aa  350  7e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  34.52 
 
 		 666 aa  331  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  50.61 
 
 		 674 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  36.7 
 
 		 632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  47.68 
 
 		 605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  43.92 
 
 		 566 aa  293  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  43.73 
 
 		 680 aa  293  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  37.67 
 
 		 538 aa  287  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  35.93 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  40.23 
 
 		 653 aa  259  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  43.78 
 
 		 599 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  44.7 
 
 		 617 aa  258  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  42.19 
 
 		 656 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  45.5 
 
 		 649 aa  249  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  46.67 
 
 		 573 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  45.91 
 
 		 598 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  45.91 
 
 		 598 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  45.91 
 
 		 598 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  37.16 
 
 		 989 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  36.33 
 
 		 496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  29.7 
 
 		 533 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  33.05 
 
 		 533 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  40.34 
 
 		 900 aa  174  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  35.85 
 
 		 977 aa  174  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  28.52 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  26.29 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  26.6 
 
 		 533 aa  170  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  36.67 
 
 		 534 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  28.28 
 
 		 533 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  37.08 
 
 		 461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.5 
 
 		 849 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.42 
 
 		 848 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  34.75 
 
 		 489 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  31.92 
 
 		 531 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  29.33 
 
 		 622 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  35.79 
 
 		 554 aa  158  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  32.9 
 
 		 464 aa  158  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  34.29 
 
 		 493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  33.09 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 735 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  34.16 
 
 		 487 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  31.79 
 
 		 554 aa  154  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  33.82 
 
 		 461 aa  154  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  30.51 
 
 		 531 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  34.17 
 
 		 406 aa  153  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  34.91 
 
 		 495 aa  153  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  33.81 
 
 		 489 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.38 
 
 		 853 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  32.54 
 
 		 403 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.3 
 
 		 856 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  33.45 
 
 		 470 aa  151  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.92 
 
 		 855 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  31.21 
 
 		 594 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  31.21 
 
 		 594 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  34.69 
 
 		 472 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  33.82 
 
 		 495 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.33 
 
 		 530 aa  147  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  39.11 
 
 		 531 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  38.33 
 
 		 551 aa  147  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  31.39 
 
 		 416 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  33.58 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  32 
 
 		 489 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.06 
 
 		 856 aa  144  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.04 
 
 		 991 aa  144  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  26.85 
 
 		 535 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  32.7 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  28.54 
 
 		 535 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  33.92 
 
 		 1029 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  33.22 
 
 		 525 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  34.65 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  35.11 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  27.86 
 
 		 619 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  37.44 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  33.82 
 
 		 411 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  35.68 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  26.83 
 
 		 534 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.09 
 
 		 533 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  27.49 
 
 		 534 aa  140  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 554 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 554 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  31.25 
 
 		 441 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  30.2 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>