More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1366 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  57.76 
 
 		 714 aa  675    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 620 aa  1244    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  60 
 
 		 606 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  50.32 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  52.87 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  50.24 
 
 		 585 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  51.05 
 
 		 585 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  43.01 
 
 		 684 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  48.62 
 
 		 620 aa  467  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  46.85 
 
 		 661 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  43.84 
 
 		 640 aa  425  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  43.79 
 
 		 584 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  42.18 
 
 		 581 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  40.68 
 
 		 564 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  44.3 
 
 		 547 aa  362  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  40.41 
 
 		 566 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  35.47 
 
 		 607 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  36.03 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  43.39 
 
 		 674 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  37.87 
 
 		 550 aa  300  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  46.41 
 
 		 605 aa  292  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  37.34 
 
 		 538 aa  290  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  41.98 
 
 		 680 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  32.92 
 
 		 632 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  36.94 
 
 		 573 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  40.8 
 
 		 666 aa  250  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  42.68 
 
 		 653 aa  250  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  42.82 
 
 		 617 aa  249  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  41.96 
 
 		 656 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  41.87 
 
 		 599 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  46.77 
 
 		 649 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  42.62 
 
 		 598 aa  234  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  42.62 
 
 		 598 aa  234  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  42.62 
 
 		 598 aa  234  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  30.97 
 
 		 496 aa  217  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  31.88 
 
 		 989 aa  199  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  35.03 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  27.93 
 
 		 885 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  34.18 
 
 		 534 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  29.76 
 
 		 457 aa  177  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  28.09 
 
 		 533 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  27.88 
 
 		 489 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  28.25 
 
 		 533 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  28.6 
 
 		 495 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  28.24 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.29 
 
 		 849 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  27.92 
 
 		 532 aa  169  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  27.75 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  29.06 
 
 		 464 aa  168  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  27.85 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  34.9 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  27.8 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  28.96 
 
 		 495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  27.96 
 
 		 493 aa  164  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.59 
 
 		 848 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  30.28 
 
 		 622 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  29.33 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  30.47 
 
 		 461 aa  161  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  33.23 
 
 		 531 aa  157  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  35.49 
 
 		 461 aa  156  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  34.45 
 
 		 900 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.72 
 
 		 977 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  34.58 
 
 		 532 aa  153  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  29.39 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  26.43 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  31.27 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  27.47 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  27.58 
 
 		 532 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.69 
 
 		 530 aa  150  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.38 
 
 		 839 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  26.32 
 
 		 489 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.68 
 
 		 856 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.49 
 
 		 856 aa  148  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  33.98 
 
 		 556 aa  148  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  28.12 
 
 		 619 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  28.01 
 
 		 613 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.68 
 
 		 531 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  26.92 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  27.8 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 530 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  26.73 
 
 		 496 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  32.35 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  32.36 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  28.16 
 
 		 613 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.39 
 
 		 533 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  34.98 
 
 		 532 aa  144  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  28.18 
 
 		 605 aa  144  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  35.87 
 
 		 534 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  27.44 
 
 		 525 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.23 
 
 		 735 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  31.72 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  32.23 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  30 
 
 		 406 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.89 
 
 		 853 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  35.27 
 
 		 534 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  32.13 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  30.89 
 
 		 535 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  36.92 
 
 		 471 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  30.31 
 
 		 410 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 535 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>