More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3824 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 656 aa  1327    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  38.31 
 
 		 666 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  44.19 
 
 		 653 aa  330  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  35.47 
 
 		 581 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  51.94 
 
 		 566 aa  308  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  49.51 
 
 		 603 aa  303  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  45.63 
 
 		 607 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  34.82 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  47.42 
 
 		 680 aa  293  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  33.61 
 
 		 620 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  31.89 
 
 		 714 aa  286  9e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  52.84 
 
 		 617 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  52.87 
 
 		 632 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  32.39 
 
 		 670 aa  279  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  44.29 
 
 		 674 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  52.22 
 
 		 599 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  50.17 
 
 		 550 aa  266  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  42.94 
 
 		 585 aa  261  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  39.89 
 
 		 606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  40.44 
 
 		 684 aa  259  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  44.48 
 
 		 649 aa  250  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  41.54 
 
 		 564 aa  249  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  46.86 
 
 		 538 aa  247  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  50.85 
 
 		 598 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  50 
 
 		 573 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  50.85 
 
 		 598 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  43.28 
 
 		 661 aa  245  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  50.85 
 
 		 598 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  41.04 
 
 		 640 aa  242  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  42.94 
 
 		 585 aa  240  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  40.32 
 
 		 635 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  39.77 
 
 		 620 aa  232  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  41.21 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  40.91 
 
 		 496 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  30.17 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  35.58 
 
 		 533 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  35.39 
 
 		 533 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  37.24 
 
 		 533 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  33.96 
 
 		 533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  34.21 
 
 		 532 aa  173  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  36.88 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  34.3 
 
 		 533 aa  165  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  35.46 
 
 		 533 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  37.55 
 
 		 531 aa  163  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  33.94 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  35.49 
 
 		 532 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  35.65 
 
 		 530 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  36.08 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  34.52 
 
 		 532 aa  161  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  33.79 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  34.19 
 
 		 535 aa  160  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  33.22 
 
 		 530 aa  160  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  31.39 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  34.41 
 
 		 594 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  36.5 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  34.41 
 
 		 594 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  34.84 
 
 		 554 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  32.12 
 
 		 461 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  32.31 
 
 		 554 aa  158  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  36.5 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  34.94 
 
 		 403 aa  157  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.97 
 
 		 761 aa  157  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  37.33 
 
 		 900 aa  156  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.29 
 
 		 853 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  35.56 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 410 aa  154  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.2 
 
 		 735 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  35.13 
 
 		 530 aa  154  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  35.37 
 
 		 468 aa  154  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  32.82 
 
 		 533 aa  154  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  31.27 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  37.01 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  31.91 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.41 
 
 		 989 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  32.66 
 
 		 613 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  32.66 
 
 		 613 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  39.02 
 
 		 524 aa  152  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  34.93 
 
 		 533 aa  152  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.7 
 
 		 848 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.66 
 
 		 856 aa  151  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  33.97 
 
 		 535 aa  151  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  33.45 
 
 		 495 aa  151  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  35.17 
 
 		 474 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 474 aa  150  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  32.52 
 
 		 532 aa  150  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  32.32 
 
 		 613 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  34.15 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  33.57 
 
 		 556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  30.42 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.1 
 
 		 849 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  32.21 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  31.8 
 
 		 441 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.23 
 
 		 995 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  31.72 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  35.74 
 
 		 462 aa  147  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  36.86 
 
 		 512 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  29.87 
 
 		 525 aa  147  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  32.34 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  35 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  35 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>