More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2583 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  69.82 
 
 		 573 aa  714    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 599 aa  1172    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  87.19 
 
 		 617 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  86.63 
 
 		 598 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  86.63 
 
 		 598 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  86.63 
 
 		 598 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  52.24 
 
 		 603 aa  568  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  49.68 
 
 		 632 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  59.51 
 
 		 550 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  59.71 
 
 		 538 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  42.4 
 
 		 581 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  37.08 
 
 		 666 aa  337  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  46.47 
 
 		 566 aa  335  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  57.01 
 
 		 649 aa  333  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  36.73 
 
 		 714 aa  329  8e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  39.76 
 
 		 584 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  36.82 
 
 		 670 aa  323  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  55.9 
 
 		 605 aa  317  4e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  35.7 
 
 		 620 aa  309  8e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  36.58 
 
 		 661 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 564 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  38.95 
 
 		 547 aa  298  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  46.71 
 
 		 607 aa  296  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  50.8 
 
 		 656 aa  296  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  46.49 
 
 		 680 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  34.13 
 
 		 585 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  37.87 
 
 		 684 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  35.69 
 
 		 640 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  45.38 
 
 		 635 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  45.97 
 
 		 674 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  48.38 
 
 		 653 aa  275  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  44.24 
 
 		 606 aa  273  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  32.78 
 
 		 585 aa  251  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  42.18 
 
 		 620 aa  246  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  43.1 
 
 		 496 aa  212  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  36.07 
 
 		 533 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  37.95 
 
 		 534 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  38.28 
 
 		 533 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  37.18 
 
 		 532 aa  190  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  39.12 
 
 		 533 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  36.31 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  36.96 
 
 		 594 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  36.96 
 
 		 594 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  36.31 
 
 		 554 aa  183  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.53 
 
 		 530 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.43 
 
 		 856 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  36.11 
 
 		 761 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.07 
 
 		 556 aa  181  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.76 
 
 		 849 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.9 
 
 		 406 aa  180  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.01 
 
 		 848 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  39.4 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.55 
 
 		 532 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  40.23 
 
 		 530 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  39.43 
 
 		 533 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.74 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  38.81 
 
 		 533 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  37.37 
 
 		 535 aa  176  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  37.04 
 
 		 554 aa  176  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.28 
 
 		 853 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  34.45 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  38.85 
 
 		 900 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  38.75 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.48 
 
 		 856 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 		 532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 		 533 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  38.11 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  38.24 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  36.1 
 
 		 531 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  32.95 
 
 		 410 aa  170  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  38.89 
 
 		 735 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.69 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  36.61 
 
 		 535 aa  169  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.69 
 
 		 995 aa  169  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  38.58 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  34.92 
 
 		 445 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  36.17 
 
 		 525 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  36.59 
 
 		 413 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  36.5 
 
 		 530 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  40.23 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  37.38 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  37.68 
 
 		 622 aa  165  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 		 534 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  35.66 
 
 		 977 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  35.26 
 
 		 989 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  36.43 
 
 		 537 aa  163  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  33.9 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.29 
 
 		 855 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  32.87 
 
 		 416 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.49 
 
 		 554 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  38.46 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  34.49 
 
 		 554 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  35.93 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  37.22 
 
 		 535 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  32.36 
 
 		 461 aa  160  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  33.45 
 
 		 554 aa  160  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  33.22 
 
 		 1029 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  32.12 
 
 		 534 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  34.78 
 
 		 487 aa  159  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>