More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2323 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 598 aa  1183    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 598 aa  1183    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 598 aa  1183    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  74.21 
 
 		 573 aa  769    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  87.85 
 
 		 599 aa  599  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  83.57 
 
 		 617 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  51.07 
 
 		 603 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  54.56 
 
 		 550 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  49.38 
 
 		 632 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  60.8 
 
 		 538 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  42.53 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  40.4 
 
 		 584 aa  337  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  38.14 
 
 		 714 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  57.63 
 
 		 649 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  37.37 
 
 		 670 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  37.48 
 
 		 620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  54.12 
 
 		 605 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  36.33 
 
 		 564 aa  296  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  42.68 
 
 		 680 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  34.9 
 
 		 606 aa  294  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  50.85 
 
 		 656 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  46.41 
 
 		 607 aa  292  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  36.13 
 
 		 661 aa  289  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  34.24 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  37.64 
 
 		 547 aa  286  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  43.54 
 
 		 635 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  41.65 
 
 		 653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  34.93 
 
 		 640 aa  267  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  47.12 
 
 		 666 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  41.69 
 
 		 684 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  44.3 
 
 		 620 aa  243  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  41.6 
 
 		 585 aa  236  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  42.09 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  39.74 
 
 		 533 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  40.91 
 
 		 533 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  38.96 
 
 		 534 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  38.8 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  39.86 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  36.14 
 
 		 554 aa  186  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.82 
 
 		 556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  40.07 
 
 		 531 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  36.59 
 
 		 594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  36.59 
 
 		 594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.68 
 
 		 849 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.06 
 
 		 995 aa  177  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  38.91 
 
 		 530 aa  177  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  39.56 
 
 		 532 aa  176  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.67 
 
 		 554 aa  176  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.46 
 
 		 848 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.77 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  36.82 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.21 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  34.28 
 
 		 410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  40.43 
 
 		 900 aa  174  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.03 
 
 		 532 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  38.81 
 
 		 533 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.31 
 
 		 533 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.16 
 
 		 989 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  35.35 
 
 		 535 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.08 
 
 		 853 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  37.72 
 
 		 532 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.82 
 
 		 856 aa  171  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  36.39 
 
 		 515 aa  171  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.67 
 
 		 856 aa  170  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  33.62 
 
 		 532 aa  170  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  36.62 
 
 		 761 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  39.58 
 
 		 535 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  41 
 
 		 533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.01 
 
 		 735 aa  166  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  38.31 
 
 		 532 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  34.31 
 
 		 1029 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  36.96 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.97 
 
 		 531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  34.16 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  33.43 
 
 		 534 aa  164  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  33.02 
 
 		 416 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  36.43 
 
 		 537 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  38.96 
 
 		 622 aa  163  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  37.06 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  38.25 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  34.58 
 
 		 445 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  36.99 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  34.47 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  34.53 
 
 		 493 aa  161  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  40.08 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  36.4 
 
 		 503 aa  161  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  34.63 
 
 		 530 aa  160  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  37.46 
 
 		 534 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.8 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  35.06 
 
 		 399 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.33 
 
 		 977 aa  158  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  34.74 
 
 		 554 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  32.86 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.74 
 
 		 554 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  34.4 
 
 		 525 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  33.24 
 
 		 461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  37.18 
 
 		 533 aa  157  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>