More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 661 aa  1292    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  47.69 
 
 		 714 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  46.84 
 
 		 670 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  46.99 
 
 		 606 aa  469  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  44.85 
 
 		 620 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  46.42 
 
 		 585 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  47.12 
 
 		 585 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  44.39 
 
 		 635 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  43.62 
 
 		 620 aa  405  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  43.32 
 
 		 640 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  41.27 
 
 		 684 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  39.53 
 
 		 581 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  42.74 
 
 		 566 aa  359  8e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  40.85 
 
 		 584 aa  357  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  38.24 
 
 		 564 aa  339  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  50.14 
 
 		 674 aa  326  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  37.93 
 
 		 607 aa  323  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  36.25 
 
 		 538 aa  305  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  38.85 
 
 		 547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  35.22 
 
 		 550 aa  290  9e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  34.83 
 
 		 632 aa  280  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  45.16 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  39.32 
 
 		 680 aa  273  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  45.37 
 
 		 603 aa  273  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  44.9 
 
 		 666 aa  264  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  45.82 
 
 		 653 aa  263  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  40.96 
 
 		 656 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  43.09 
 
 		 617 aa  232  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  43.37 
 
 		 599 aa  232  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  47.27 
 
 		 649 aa  226  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  41.52 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  43.04 
 
 		 598 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  43.04 
 
 		 598 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  43.04 
 
 		 598 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  39.56 
 
 		 496 aa  204  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  31.03 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  27.47 
 
 		 989 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  27.98 
 
 		 493 aa  164  7e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  25.33 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  26 
 
 		 489 aa  162  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  27.86 
 
 		 533 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  26.39 
 
 		 487 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  39 
 
 		 977 aa  160  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  26.38 
 
 		 489 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  33.79 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  34.8 
 
 		 403 aa  160  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  36.4 
 
 		 531 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  34.1 
 
 		 532 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  28.74 
 
 		 533 aa  158  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  27.59 
 
 		 885 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.83 
 
 		 533 aa  156  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  34.1 
 
 		 533 aa  156  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  39.74 
 
 		 900 aa  156  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  28.09 
 
 		 533 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.84 
 
 		 849 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  35.96 
 
 		 532 aa  154  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.96 
 
 		 735 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  24.56 
 
 		 496 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  25.7 
 
 		 474 aa  152  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  36.65 
 
 		 461 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  34.89 
 
 		 495 aa  150  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  32.92 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  36.78 
 
 		 525 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  28 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  36.74 
 
 		 495 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  33.21 
 
 		 554 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.04 
 
 		 856 aa  147  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  32.19 
 
 		 594 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  32.19 
 
 		 594 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  31.23 
 
 		 406 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.2 
 
 		 848 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  31.79 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  33.9 
 
 		 533 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  34.38 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  32.48 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  37.85 
 
 		 470 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.46 
 
 		 839 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  36.18 
 
 		 535 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  32.96 
 
 		 535 aa  143  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  36.25 
 
 		 474 aa  143  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  35.69 
 
 		 534 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  31.42 
 
 		 531 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  35.92 
 
 		 535 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  35.69 
 
 		 534 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  34.22 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  34.56 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.44 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  34.48 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  36.08 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  34.6 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  33.99 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  30.71 
 
 		 416 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  34.22 
 
 		 465 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  32.48 
 
 		 530 aa  140  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  32.66 
 
 		 532 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 530 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  33.12 
 
 		 487 aa  140  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  30.57 
 
 		 554 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.88 
 
 		 855 aa  138  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  32.4 
 
 		 419 aa  138  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>