More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2256 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.4 
 
 
1055 aa  722    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.74 
 
 
981 aa  673    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  54.81 
 
 
995 aa  1081    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.55 
 
 
995 aa  671    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  41.04 
 
 
1029 aa  700    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.18 
 
 
996 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  55.02 
 
 
1001 aa  1083    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
991 aa  1996    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.88 
 
 
991 aa  690    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.22 
 
 
990 aa  725    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  39.39 
 
 
622 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.03 
 
 
856 aa  353  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.55 
 
 
856 aa  344  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  34.17 
 
 
849 aa  341  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  29.09 
 
 
989 aa  333  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.88 
 
 
853 aa  333  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  33.98 
 
 
759 aa  332  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  36.5 
 
 
605 aa  327  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.78 
 
 
740 aa  326  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.86 
 
 
735 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.28 
 
 
848 aa  310  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.91 
 
 
845 aa  309  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.31 
 
 
834 aa  308  5.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.75 
 
 
844 aa  306  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  36.55 
 
 
594 aa  305  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 
638 aa  302  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.26 
 
 
844 aa  301  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  34.63 
 
 
607 aa  301  6e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.49 
 
 
849 aa  300  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.96 
 
 
761 aa  300  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  33.63 
 
 
619 aa  295  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  30.23 
 
 
843 aa  294  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.93 
 
 
748 aa  294  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  34.73 
 
 
595 aa  291  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.56 
 
 
846 aa  290  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.44 
 
 
846 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.03 
 
 
750 aa  282  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33 
 
 
785 aa  281  5e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33 
 
 
785 aa  281  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.44 
 
 
759 aa  281  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.57 
 
 
839 aa  278  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.04 
 
 
844 aa  277  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.38 
 
 
752 aa  277  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  33.13 
 
 
624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.27 
 
 
754 aa  270  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.27 
 
 
754 aa  270  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.22 
 
 
754 aa  270  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.27 
 
 
754 aa  270  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.11 
 
 
754 aa  269  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.96 
 
 
1400 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.83 
 
 
750 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.11 
 
 
754 aa  268  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.05 
 
 
762 aa  268  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.11 
 
 
754 aa  267  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.11 
 
 
754 aa  267  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.05 
 
 
754 aa  266  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  33.61 
 
 
793 aa  266  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.58 
 
 
755 aa  264  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  47.45 
 
 
531 aa  257  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  49.45 
 
 
530 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.1 
 
 
756 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  45.26 
 
 
532 aa  242  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  47.01 
 
 
532 aa  238  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  48.86 
 
 
526 aa  237  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  45.59 
 
 
554 aa  237  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.54 
 
 
763 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  45.96 
 
 
554 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  48.33 
 
 
533 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  45.96 
 
 
554 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  29.98 
 
 
734 aa  235  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  49.26 
 
 
533 aa  234  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  46.84 
 
 
554 aa  234  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  45.26 
 
 
533 aa  233  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  32.5 
 
 
525 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  45.22 
 
 
554 aa  232  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  39.23 
 
 
308 aa  231  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.8 
 
 
759 aa  230  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.8 
 
 
759 aa  230  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  46.1 
 
 
530 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  36.45 
 
 
531 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  43.75 
 
 
554 aa  229  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  26.75 
 
 
885 aa  228  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.63 
 
 
858 aa  227  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  44.98 
 
 
532 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  44.98 
 
 
532 aa  226  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  45.59 
 
 
533 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.08 
 
 
855 aa  224  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  45.52 
 
 
534 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  45.35 
 
 
530 aa  221  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  44.03 
 
 
533 aa  221  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  30.74 
 
 
611 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  45.59 
 
 
535 aa  220  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  41.67 
 
 
512 aa  220  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  42.86 
 
 
522 aa  218  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  43.66 
 
 
532 aa  218  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  45.15 
 
 
533 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  44.74 
 
 
526 aa  216  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  46.1 
 
 
524 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  41.85 
 
 
537 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  43.9 
 
 
510 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>