83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0276 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  76.33 
 
 		 207 aa  337  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  44.29 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  41.82 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  43.96 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  45.13 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  43 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  42.38 
 
 		 209 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  44.21 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  39.02 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  39.02 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  41.52 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  39.3 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  39.69 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  41.24 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  43.02 
 
 		 266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  39.2 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  43.83 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  39.46 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  42.35 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  43.51 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  36.1 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  43.51 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  36.95 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  38.81 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  38.83 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  38.79 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  42.77 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  38.03 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  41.4 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  41.88 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  37.36 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  37.8 
 
 		 183 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  36.72 
 
 		 335 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  41.14 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  34.92 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  30.36 
 
 		 875 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 		 789 aa  95.5  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.48 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  34.21 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  30.48 
 
 		 323 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  35.96 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  56.04 
 
 		 286 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  30.43 
 
 		 964 aa  85.5  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  32.27 
 
 		 674 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 1054 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  33.74 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  29.86 
 
 		 1297 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  42.98 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  40.5 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  30.99 
 
 		 238 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  29.13 
 
 		 776 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  30.96 
 
 		 787 aa  68.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  28.81 
 
 		 743 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  37.04 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  37.04 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  38.61 
 
 		 588 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  37.04 
 
 		 431 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  37.04 
 
 		 296 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  35 
 
 		 359 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  45.83 
 
 		 367 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  44.9 
 
 		 295 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  45.83 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  45.83 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  45.83 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  27.81 
 
 		 746 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  49.12 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  30.77 
 
 		 384 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  36.25 
 
 		 353 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  46.94 
 
 		 989 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  43.75 
 
 		 368 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  33.75 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1232  uridylate kinase  31.55 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0721616  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  58.33 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  36.51 
 
 		 284 aa  45.1  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1324  uridylate kinase  30.95 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  40.74 
 
 		 464 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  40.58 
 
 		 264 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  24.22 
 
 		 740 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>