25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3140 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3140  chitinase  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  34.91 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  40.61 
 
 		 384 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  39.29 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  36.07 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  37.97 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  36.36 
 
 		 359 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  31.76 
 
 		 565 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  34.91 
 
 		 368 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  36.96 
 
 		 353 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  27.43 
 
 		 553 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  27.43 
 
 		 587 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  27.43 
 
 		 587 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  27.43 
 
 		 587 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  27.43 
 
 		 587 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  34.36 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  34.36 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  34.36 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  34.09 
 
 		 709 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  29.66 
 
 		 574 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  34.36 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  32.09 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  35.66 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  28.14 
 
 		 567 aa  72  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  36.51 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>