71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1172 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  67.96 
 
 		 182 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  65.96 
 
 		 189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  65.93 
 
 		 183 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  69.23 
 
 		 181 aa  233  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  62.3 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  55.85 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  55.85 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  57.61 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  55.85 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  53.59 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  50.7 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  52.13 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  44.27 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  50.71 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  38.83 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  40.84 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  37.75 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  43.33 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  36.61 
 
 		 323 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  37.93 
 
 		 322 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  39.04 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  39.04 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  35.8 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  40.97 
 
 		 259 aa  94.4  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.61 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  34.07 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  34.07 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 264 aa  88.2  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  33.7 
 
 		 197 aa  87.8  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  32.98 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  35.48 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  35.48 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  36.02 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  30.81 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  32.27 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  32.95 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  29.55 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 		 789 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  31.22 
 
 		 674 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  28.82 
 
 		 875 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  29.61 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  31.29 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  26.82 
 
 		 776 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  29.01 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  29.44 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  25.24 
 
 		 743 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  28.35 
 
 		 964 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 1054 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  41.18 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  41.18 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  34 
 
 		 359 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  34.33 
 
 		 295 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  30.29 
 
 		 588 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  38.95 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  30.14 
 
 		 709 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  31.74 
 
 		 368 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  32.43 
 
 		 296 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  33.33 
 
 		 353 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  37.93 
 
 		 989 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  41.18 
 
 		 286 aa  44.7  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  34.04 
 
 		 787 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  35.79 
 
 		 746 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 		 363 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  30.63 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  28.4 
 
 		 266 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  28.4 
 
 		 266 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  28.4 
 
 		 266 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>