57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02039 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  100 
 
 		 964 aa  1989    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  39.08 
 
 		 1054 aa  558  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  31.23 
 
 		 989 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  31 
 
 		 931 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  30.08 
 
 		 889 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  27.39 
 
 		 875 aa  107  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  22.27 
 
 		 674 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  30.43 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  25.71 
 
 		 776 aa  81.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 		 789 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  24.76 
 
 		 746 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  30.1 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  30.1 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  28.5 
 
 		 207 aa  69.3  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5413  EF hand domain protein  26.54 
 
 		 792 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  30.33 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  28.43 
 
 		 177 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  28.43 
 
 		 177 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  28.84 
 
 		 181 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  29.17 
 
 		 177 aa  62  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 177 aa  62  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  28.18 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  31.47 
 
 		 183 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  25.24 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  29 
 
 		 181 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  23.15 
 
 		 766 aa  57  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5210  EF hand domain protein  30.91 
 
 		 310 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  28.35 
 
 		 187 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5206  EF hand domain protein  29.73 
 
 		 310 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.88 
 
 		 363 aa  53.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 196 aa  52.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  36.9 
 
 		 751 aa  52.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  31.18 
 
 		 827 aa  52  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  44.44 
 
 		 1297 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  27.66 
 
 		 204 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  26.15 
 
 		 212 aa  50.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  26.13 
 
 		 211 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3274  hypothetical protein  23.94 
 
 		 910 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  24.64 
 
 		 204 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  27.87 
 
 		 238 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  33.67 
 
 		 743 aa  49.3  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  27.89 
 
 		 204 aa  48.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 		 190 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.27 
 
 		 264 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  22.68 
 
 		 204 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  32.04 
 
 		 384 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  37.74 
 
 		 245 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  30.36 
 
 		 367 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  24 
 
 		 220 aa  45.8  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  41.51 
 
 		 353 aa  45.8  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  31.11 
 
 		 776 aa  45.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 		 182 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  25 
 
 		 425 aa  45.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  29.19 
 
 		 787 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>