22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02037 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  100 
 
 
751 aa  1564    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  30.56 
 
 
776 aa  303  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  29.4 
 
 
776 aa  280  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  30.27 
 
 
497 aa  206  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3427  hypothetical protein  33.49 
 
 
418 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747618  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  26.39 
 
 
746 aa  195  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  29.24 
 
 
740 aa  192  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  29.57 
 
 
765 aa  182  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  35.62 
 
 
425 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  28.98 
 
 
765 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  29.4 
 
 
765 aa  180  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  28.79 
 
 
766 aa  175  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  41.75 
 
 
743 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  38.79 
 
 
827 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  32.85 
 
 
359 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  33.86 
 
 
931 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  29.37 
 
 
875 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  36.9 
 
 
964 aa  52.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3381  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  25.54 
 
 
655 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26749  normal  0.167867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  36.79 
 
 
989 aa  50.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 
1054 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  27.59 
 
 
889 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>