57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000427 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  100 
 
 		 743 aa  1548    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  35.73 
 
 		 674 aa  230  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  31.49 
 
 		 359 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  41.75 
 
 		 751 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  27.49 
 
 		 212 aa  69.3  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  26.38 
 
 		 1297 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 189 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  28.81 
 
 		 208 aa  63.9  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  27.8 
 
 		 875 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  28.08 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  29.69 
 
 		 211 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  27.54 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  29.82 
 
 		 220 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  27.12 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  24.48 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  36.28 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  36.63 
 
 		 989 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  38.78 
 
 		 183 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  25.24 
 
 		 187 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  34.65 
 
 		 827 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  37.17 
 
 		 177 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  33.63 
 
 		 177 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  33.63 
 
 		 177 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  40.43 
 
 		 204 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  25.61 
 
 		 245 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  35.71 
 
 		 181 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  35.77 
 
 		 181 aa  54.3  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  32.82 
 
 		 335 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  29.27 
 
 		 889 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  30.29 
 
 		 204 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  30.49 
 
 		 787 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  26.53 
 
 		 203 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  29.71 
 
 		 204 aa  51.6  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 789 aa  51.2  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  27.34 
 
 		 931 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.33 
 
 		 264 aa  51.2  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  27.48 
 
 		 776 aa  51.2  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  25.31 
 
 		 776 aa  51.2  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 		 181 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  30.26 
 
 		 183 aa  50.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 182 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  33.67 
 
 		 964 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  28.07 
 
 		 209 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  26.9 
 
 		 209 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  21.85 
 
 		 1054 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  36.63 
 
 		 204 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  36.25 
 
 		 197 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  29.52 
 
 		 323 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 264 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  36.26 
 
 		 290 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  28.37 
 
 		 209 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  31.03 
 
 		 259 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  28.04 
 
 		 425 aa  45.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  40.62 
 
 		 239 aa  44.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  41.1 
 
 		 190 aa  44.3  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  33.75 
 
 		 197 aa  43.9  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  33.75 
 
 		 197 aa  43.9  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>