67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0015 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  100 
 
 		 776 aa  1623    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  52.02 
 
 		 776 aa  618  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  73.6 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  30.56 
 
 		 751 aa  303  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3427  hypothetical protein  41.47 
 
 		 418 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  27.39 
 
 		 740 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  25.48 
 
 		 765 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  25.54 
 
 		 765 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  25.54 
 
 		 765 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  26.59 
 
 		 766 aa  207  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  27.87 
 
 		 746 aa  204  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  30.6 
 
 		 497 aa  204  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 		 1054 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  24.61 
 
 		 674 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  25.71 
 
 		 964 aa  81.3  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  23.98 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  23.57 
 
 		 827 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  29.76 
 
 		 181 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  29.13 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  28.88 
 
 		 875 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  29.84 
 
 		 1297 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 189 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  28.02 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 		 177 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  30.77 
 
 		 177 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  27.31 
 
 		 204 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 		 190 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  28.64 
 
 		 204 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  28.85 
 
 		 177 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  28.85 
 
 		 177 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  28.5 
 
 		 183 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  26.82 
 
 		 187 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  30.43 
 
 		 359 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  28.38 
 
 		 183 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  25.57 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  26.94 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  24.9 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  26.94 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  28.57 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  26.7 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  27.52 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  27.51 
 
 		 253 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  24.66 
 
 		 212 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  27.04 
 
 		 269 aa  54.7  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 181 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.94 
 
 		 264 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  27.73 
 
 		 211 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  25.31 
 
 		 743 aa  51.2  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  27 
 
 		 204 aa  50.8  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  23.36 
 
 		 323 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.64 
 
 		 264 aa  50.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  29.82 
 
 		 931 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  27.83 
 
 		 181 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  30.43 
 
 		 203 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  25.64 
 
 		 220 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  30.1 
 
 		 889 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  22.09 
 
 		 322 aa  47.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3381  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.72 
 
 		 655 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26749  normal  0.167867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  24.75 
 
 		 335 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  23.36 
 
 		 245 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  24.88 
 
 		 187 aa  45.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  29.41 
 
 		 989 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  24.78 
 
 		 209 aa  44.3  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 		 220 aa  43.9  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>