18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3251 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  53.4 
 
 		 889 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  100 
 
 		 931 aa  1923    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 1054 aa  188  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  25.9 
 
 		 875 aa  162  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  31 
 
 		 964 aa  147  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  27.87 
 
 		 989 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  36.31 
 
 		 359 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.03 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  33.86 
 
 		 751 aa  60.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  32.46 
 
 		 740 aa  55.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5210  EF hand domain protein  30.71 
 
 		 310 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  27.34 
 
 		 743 aa  51.2  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  33.62 
 
 		 776 aa  51.2  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  31.9 
 
 		 425 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  29.82 
 
 		 776 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5206  EF hand domain protein  29.17 
 
 		 310 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  32.5 
 
 		 827 aa  48.9  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5413  EF hand domain protein  27.35 
 
 		 792 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>