70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3652 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  100 
 
 		 875 aa  1820    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  25.9 
 
 		 931 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  24.21 
 
 		 889 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  32.51 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  27.18 
 
 		 964 aa  104  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  26.4 
 
 		 674 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 1054 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  30.36 
 
 		 208 aa  97.8  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  24.19 
 
 		 989 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  30.13 
 
 		 212 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  30.36 
 
 		 207 aa  93.2  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  31.82 
 
 		 211 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  39.86 
 
 		 359 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  30.37 
 
 		 203 aa  90.9  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  31.8 
 
 		 197 aa  88.2  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  31.05 
 
 		 197 aa  85.9  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  31.05 
 
 		 197 aa  85.9  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  31.09 
 
 		 789 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  26.5 
 
 		 177 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  26.5 
 
 		 177 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  29.11 
 
 		 209 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  27.93 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  27.57 
 
 		 209 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  28.57 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  27.85 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 177 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.03 
 
 		 264 aa  70.1  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  27.55 
 
 		 245 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  25.46 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.03 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  26.61 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  28.88 
 
 		 776 aa  67.8  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  27.57 
 
 		 204 aa  67.4  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  28.5 
 
 		 266 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  27.7 
 
 		 204 aa  67  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  26.94 
 
 		 253 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  26.87 
 
 		 181 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  25.7 
 
 		 322 aa  63.9  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  28.82 
 
 		 187 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  29.53 
 
 		 220 aa  63.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  27.8 
 
 		 743 aa  63.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  26.17 
 
 		 204 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  34.45 
 
 		 183 aa  62.4  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  35.58 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  35.96 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  35.16 
 
 		 259 aa  60.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  26.6 
 
 		 1297 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  26.73 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  29.37 
 
 		 751 aa  58.9  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  30.22 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  26.17 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  35.71 
 
 		 776 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  24.68 
 
 		 765 aa  58.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  24.68 
 
 		 765 aa  57.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  24.35 
 
 		 765 aa  56.2  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  33.02 
 
 		 740 aa  55.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 189 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  28.44 
 
 		 766 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  30.5 
 
 		 187 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  26.47 
 
 		 425 aa  50.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  33.87 
 
 		 286 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  27.01 
 
 		 497 aa  50.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  25.75 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  36 
 
 		 311 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6128  hypothetical protein  35.37 
 
 		 224 aa  45.8  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0831605  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  29.66 
 
 		 827 aa  45.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.279445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>