12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5413 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  90.38 
 
 		 674 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5209  hypothetical protein  97.79 
 
 		 392 aa  743    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5413  EF hand domain protein  100 
 
 		 792 aa  1639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5210  EF hand domain protein  64.23 
 
 		 310 aa  177  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5206  EF hand domain protein  64.23 
 
 		 310 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5205  hypothetical protein  63.64 
 
 		 77 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  26.54 
 
 		 964 aa  68.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 1054 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  31.71 
 
 		 989 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  21.45 
 
 		 889 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  27.35 
 
 		 931 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
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