51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2226 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  100 
 
 		 989 aa  2019    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  31.78 
 
 		 964 aa  412  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  28.94 
 
 		 1054 aa  239  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  29.14 
 
 		 931 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  26.94 
 
 		 889 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  25.47 
 
 		 875 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  35 
 
 		 201 aa  96.3  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  44.79 
 
 		 205 aa  91.3  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  42.16 
 
 		 234 aa  88.6  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  45.83 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  84  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  43.75 
 
 		 227 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  38.83 
 
 		 202 aa  83.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  44.32 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  31.67 
 
 		 204 aa  80.1  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  32.28 
 
 		 202 aa  79.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  32.28 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  23.87 
 
 		 674 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  32.95 
 
 		 264 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  30.64 
 
 		 359 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  37.82 
 
 		 237 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5210  EF hand domain protein  31.53 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5206  EF hand domain protein  31.53 
 
 		 310 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  27.47 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5413  EF hand domain protein  31.93 
 
 		 792 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  43.33 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  23 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  38.33 
 
 		 197 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  38.33 
 
 		 197 aa  53.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  38.33 
 
 		 197 aa  53.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  42.11 
 
 		 177 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  24.18 
 
 		 746 aa  52  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  34.38 
 
 		 204 aa  51.2  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 		 177 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 827 aa  51.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  34.86 
 
 		 751 aa  50.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  25.67 
 
 		 311 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  30.41 
 
 		 776 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  42.11 
 
 		 177 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  42.11 
 
 		 177 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  46.94 
 
 		 208 aa  49.3  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  41.07 
 
 		 212 aa  48.9  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  48.89 
 
 		 204 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  29.41 
 
 		 776 aa  47.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  40.68 
 
 		 335 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  48.89 
 
 		 204 aa  45.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  48.89 
 
 		 204 aa  45.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  37.93 
 
 		 187 aa  45.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  40.48 
 
 		 213 aa  45.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  39.66 
 
 		 220 aa  44.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  28.49 
 
 		 425 aa  44.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>