68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5204 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  100 
 
 		 674 aa  1396    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5413  EF hand domain protein  90.38 
 
 		 792 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  35.73 
 
 		 743 aa  230  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5206  EF hand domain protein  87.72 
 
 		 310 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5210  EF hand domain protein  87.72 
 
 		 310 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5209  hypothetical protein  70.42 
 
 		 392 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5205  hypothetical protein  64.94 
 
 		 77 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  26.4 
 
 		 875 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  22.38 
 
 		 1054 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  33.16 
 
 		 211 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  22.27 
 
 		 964 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  32.27 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  24.61 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  34.17 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  23.87 
 
 		 989 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  30.85 
 
 		 1297 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 789 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  28.28 
 
 		 207 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  37.3 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  28.17 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  37.4 
 
 		 209 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  31.52 
 
 		 787 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  31.22 
 
 		 187 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  28.29 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  28.92 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  34.92 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  27.32 
 
 		 204 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  29.59 
 
 		 197 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  31.52 
 
 		 204 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  29.49 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  27.68 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  27.32 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  28.27 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  28.27 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.83 
 
 		 264 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  21.26 
 
 		 889 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  27.14 
 
 		 766 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  30.11 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  30.11 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  30.65 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  26.06 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  29.51 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  28.75 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  40.45 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  29.59 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  26.15 
 
 		 238 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 190 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  35 
 
 		 264 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 220 aa  55.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  24.13 
 
 		 740 aa  55.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  26.5 
 
 		 183 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  23.85 
 
 		 323 aa  54.3  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  26.32 
 
 		 204 aa  54.3  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 196 aa  53.9  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  30.88 
 
 		 266 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  25.39 
 
 		 746 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 181 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  26.32 
 
 		 187 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  24.47 
 
 		 765 aa  51.2  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  24.47 
 
 		 765 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  24.47 
 
 		 765 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  33.61 
 
 		 245 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 		 182 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  26.6 
 
 		 253 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  25.45 
 
 		 181 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  25.96 
 
 		 335 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  35.59 
 
 		 286 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>