22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3426 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  879    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  73.6 
 
 		 776 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  59.16 
 
 		 776 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  35.62 
 
 		 751 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  33.07 
 
 		 740 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  31.93 
 
 		 497 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  32.11 
 
 		 765 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  32.11 
 
 		 765 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  32.11 
 
 		 766 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  31.84 
 
 		 765 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  30.75 
 
 		 746 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  30.71 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 1054 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 827 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  26.47 
 
 		 875 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  31.9 
 
 		 931 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  29.82 
 
 		 889 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  28.49 
 
 		 989 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6128  hypothetical protein  43.55 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0831605  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  25 
 
 		 964 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  28.04 
 
 		 743 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3381  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.12 
 
 		 655 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26749  normal  0.167867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>