22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5198 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  100 
 
 		 776 aa  1625    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  52.02 
 
 		 776 aa  618  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  59.16 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  29.4 
 
 		 751 aa  280  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3427  hypothetical protein  40.15 
 
 		 418 aa  205  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  28.8 
 
 		 497 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  28.84 
 
 		 765 aa  178  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  28.84 
 
 		 765 aa  177  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  28.01 
 
 		 766 aa  177  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  28.84 
 
 		 765 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  27.61 
 
 		 740 aa  170  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  26.8 
 
 		 746 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  25.35 
 
 		 827 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  34.23 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  35.71 
 
 		 875 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 1054 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3381  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.61 
 
 		 655 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26749  normal  0.167867 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  27.48 
 
 		 743 aa  51.2  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  33.62 
 
 		 931 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  35.85 
 
 		 989 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  31.11 
 
 		 964 aa  45.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  33 
 
 		 889 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>