19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0734 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  100 
 
 
740 aa  1551    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  46.67 
 
 
766 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  45.44 
 
 
765 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  45.44 
 
 
765 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  44.91 
 
 
765 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  49.71 
 
 
497 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  34.79 
 
 
746 aa  362  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  27.39 
 
 
776 aa  213  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  29.24 
 
 
751 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  27.61 
 
 
776 aa  170  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  33.07 
 
 
425 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  24.13 
 
 
674 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  33.02 
 
 
875 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  32.46 
 
 
931 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  34.95 
 
 
889 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  32.33 
 
 
359 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6128  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0831605  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  22.17 
 
 
1054 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  34 
 
 
827 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.279445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>