79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4583 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 181 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  76.67 
 
 		 181 aa  284  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  73.08 
 
 		 183 aa  270  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  70.74 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  69.61 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  68.11 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  67.4 
 
 		 182 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  65.95 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  65.95 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  69.23 
 
 		 187 aa  233  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  55 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  50.48 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  52.4 
 
 		 209 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  51.18 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  49.7 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  50.96 
 
 		 209 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  42.21 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  39.2 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  39.9 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  41.94 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  44.74 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  37.88 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  43.56 
 
 		 322 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  36.95 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  38.73 
 
 		 323 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  38.3 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  37.44 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  37.17 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  35.54 
 
 		 238 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 264 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  38.3 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  32.86 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  42.42 
 
 		 259 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  33.8 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  33.15 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  33.15 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  32.58 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  34.38 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  34.5 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  37.85 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  32.58 
 
 		 295 aa  77.4  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  31.68 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  30.54 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 789 aa  71.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  30.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  44.58 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  44.58 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  31.03 
 
 		 588 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  31.68 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  32.4 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 1054 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  32.54 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  33.83 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  36.09 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  30.9 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  29.85 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  29.23 
 
 		 964 aa  61.6  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  28.36 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  26.76 
 
 		 875 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  27.59 
 
 		 431 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  26.07 
 
 		 776 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  36.27 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  36.27 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  36.27 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  35.44 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  29.61 
 
 		 674 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  34.34 
 
 		 743 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  37 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  29.91 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  33.88 
 
 		 1297 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  34.09 
 
 		 787 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  39.6 
 
 		 286 aa  44.7  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  32.71 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  44.19 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  32.65 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  40.26 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  40 
 
 		 989 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  44.19 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>