68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3452 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  53.37 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  58.18 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  58.18 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  58.79 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  58.18 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  57.58 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  55.49 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.79 
 
 		 264 aa  153  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.79 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  44.27 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  54.05 
 
 		 196 aa  144  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  51.18 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  49.41 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  47.73 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  46.75 
 
 		 183 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  40.84 
 
 		 187 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  47.2 
 
 		 322 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  42.11 
 
 		 323 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  44.56 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  45.1 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  42.06 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  42.06 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  36.68 
 
 		 212 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  34.92 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  38.65 
 
 		 238 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  36.67 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  34.39 
 
 		 207 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  37.37 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  34.34 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  36.04 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  34.34 
 
 		 204 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  32.09 
 
 		 197 aa  89.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  35.08 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  32.39 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  32.39 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  29.38 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  31.94 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  31.18 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  34.02 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  34.45 
 
 		 875 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  33.33 
 
 		 253 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  28.38 
 
 		 776 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  30.65 
 
 		 674 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  38.89 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  30.98 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  38.89 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 789 aa  54.7  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  31.28 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  39.77 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  33.83 
 
 		 295 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  30.26 
 
 		 743 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  31.18 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  33.33 
 
 		 359 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  30.34 
 
 		 296 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 1054 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  30.19 
 
 		 384 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  34.62 
 
 		 367 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  34.91 
 
 		 368 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  25.49 
 
 		 964 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  36.89 
 
 		 431 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  46.77 
 
 		 290 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  34.78 
 
 		 1297 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  30.22 
 
 		 588 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  33.96 
 
 		 353 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  36.63 
 
 		 286 aa  41.6  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  31.53 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>