45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5898 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  100 
 
 		 1297 aa  2694    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  52.53 
 
 		 787 aa  268  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1194  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1347 aa  237  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3275  hypothetical protein  43.15 
 
 		 164 aa  124  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.998935  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2607  hypothetical protein  39.58 
 
 		 161 aa  105  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2260  hypothetical protein  39.04 
 
 		 159 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00499879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  30.85 
 
 		 674 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  29.86 
 
 		 208 aa  77.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  29.82 
 
 		 207 aa  72.8  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  30.47 
 
 		 204 aa  68.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  29.84 
 
 		 776 aa  67  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  26.38 
 
 		 743 aa  66.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  35.33 
 
 		 197 aa  65.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  35.33 
 
 		 197 aa  65.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  36.36 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  29.39 
 
 		 204 aa  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  35.62 
 
 		 212 aa  63.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  29.39 
 
 		 204 aa  61.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 789 aa  61.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  33.55 
 
 		 204 aa  60.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  26.6 
 
 		 875 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 		 1054 aa  58.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 190 aa  54.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  32.03 
 
 		 209 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  30.09 
 
 		 177 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  30.09 
 
 		 177 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  37.35 
 
 		 187 aa  53.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  28.65 
 
 		 220 aa  51.6  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  30.86 
 
 		 204 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  33.11 
 
 		 290 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  44.44 
 
 		 964 aa  50.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  37.84 
 
 		 177 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  36.04 
 
 		 189 aa  48.9  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  34.43 
 
 		 209 aa  48.5  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  37.5 
 
 		 211 aa  48.5  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  40.91 
 
 		 269 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  31.91 
 
 		 311 aa  47.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  36.49 
 
 		 177 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  37.8 
 
 		 266 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  39.13 
 
 		 245 aa  47.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  36.71 
 
 		 253 aa  45.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 		 181 aa  45.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  43.14 
 
 		 201 aa  45.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  29.55 
 
 		 183 aa  45.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  33.33 
 
 		 181 aa  45.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>