51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4051 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  68.95 
 
 		 311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  42.79 
 
 		 237 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  38.73 
 
 		 201 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  37.95 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  35.68 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  46.56 
 
 		 253 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  44.38 
 
 		 220 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  48.33 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  49.51 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  33.19 
 
 		 234 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  33.82 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  44.54 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  28.78 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  41.74 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  34.65 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  31.62 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  46 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  33.96 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  42.98 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  54.05 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  32.14 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  31.4 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  32.32 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  28.02 
 
 		 989 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  48.57 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  38.37 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  44 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  33.98 
 
 		 197 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  33.11 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  38.68 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  33.66 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  33.66 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  32.45 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  44 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  33.57 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  33.03 
 
 		 204 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  33.11 
 
 		 1297 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  33.33 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  31.31 
 
 		 204 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  43.84 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  38.2 
 
 		 789 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  34 
 
 		 787 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  36.26 
 
 		 743 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  40.26 
 
 		 181 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  36.11 
 
 		 875 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  37.66 
 
 		 189 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  40.28 
 
 		 190 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  46.77 
 
 		 183 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  40.26 
 
 		 181 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>