27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1223 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  93.39 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  45.86 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  50.69 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  41.76 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  35.48 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  42.67 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  34.22 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  35.83 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  35.52 
 
 		 202 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  35.8 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  36.9 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  35.29 
 
 		 264 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  43.75 
 
 		 989 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  31.4 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  32.69 
 
 		 335 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  28.57 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  28.57 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  26.79 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  29.49 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  28.12 
 
 		 401 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  39.68 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  44.44 
 
 		 197 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  44.44 
 
 		 197 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  39.68 
 
 		 197 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>