25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6204 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  86.57 
 
 		 205 aa  361  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  56.5 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  56.45 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  49.48 
 
 		 202 aa  191  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  42.36 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  46.63 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  42.42 
 
 		 264 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  41.41 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  40.13 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  37.95 
 
 		 290 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  35.48 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  39.35 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  34.93 
 
 		 311 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  39.22 
 
 		 989 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  28.91 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  46.51 
 
 		 181 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  26.92 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  26.92 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  30.07 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  30.07 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  32.76 
 
 		 295 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>