77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2255 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  94.87 
 
 
197 aa  373  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  94.87 
 
 
197 aa  373  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  74.75 
 
 
204 aa  306  9e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  39.13 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  43.83 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  38.34 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  37.82 
 
 
204 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  37.37 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  38.89 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  40 
 
 
335 aa  114  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  36.36 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  36.36 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  36.14 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  34.55 
 
 
220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  35.48 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  34.55 
 
 
269 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  34.57 
 
 
245 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  34.72 
 
 
213 aa  101  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  34.66 
 
 
177 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  34.78 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  31.74 
 
 
266 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  35.23 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  32.61 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  35.33 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  32.09 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  34.1 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  33.7 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  31.8 
 
 
875 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  33.33 
 
 
181 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  34.59 
 
 
183 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  29.79 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  31.49 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  33.14 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  30.58 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  30.43 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  28.57 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 
789 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  40.38 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  30.33 
 
 
964 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  36.36 
 
 
1297 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 
1054 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  29.59 
 
 
674 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  28.11 
 
 
238 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  32.32 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  27.52 
 
 
776 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  33.98 
 
 
290 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  50.88 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  28.93 
 
 
323 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.5 
 
 
264 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  38.55 
 
 
95 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  38.55 
 
 
95 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.5 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  31.52 
 
 
787 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  38.33 
 
 
989 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  32.43 
 
 
311 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  29.01 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  28.91 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  30.08 
 
 
431 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  36.25 
 
 
743 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  40.74 
 
 
588 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  24.87 
 
 
367 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  28.87 
 
 
266 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  28.87 
 
 
266 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  28.87 
 
 
266 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  25.58 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  38.3 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  28.08 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  40.43 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  40.43 
 
 
234 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  39.68 
 
 
227 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  27.01 
 
 
359 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  38.33 
 
 
227 aa  41.6  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>