45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6478 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  68.95 
 
 		 290 aa  341  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  40.43 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  34.93 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  34.93 
 
 		 202 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  50.89 
 
 		 220 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  50 
 
 		 253 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  35.02 
 
 		 201 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  32.82 
 
 		 264 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  30.7 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  48.25 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  49.52 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  49 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  35.76 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  33.03 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  37.5 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  33.49 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  51.39 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  35.76 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  48.57 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  46.15 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  38.24 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  36.19 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  36.28 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  44.74 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  35.78 
 
 		 204 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  31.79 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  43.84 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  26.2 
 
 		 989 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  32.24 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  35.14 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  36 
 
 		 875 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  32.35 
 
 		 197 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  32.35 
 
 		 197 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  32.43 
 
 		 197 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  37.01 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2943  protein of unknown function DUF847  75.76 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94317  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  30.07 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  31.91 
 
 		 1297 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  32.52 
 
 		 189 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  28.79 
 
 		 743 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  27.49 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>