31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2001 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  86.57 
 
 		 202 aa  361  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  55.94 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  55.56 
 
 		 236 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  43.56 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  43 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  41.41 
 
 		 264 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  39.39 
 
 		 264 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  37.82 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  35.68 
 
 		 290 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  36.51 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  34.22 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  34.93 
 
 		 311 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  35.95 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  44.79 
 
 		 989 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  29.01 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  46.51 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  27.69 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  27.69 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  58.33 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  29.01 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  29.01 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  38.78 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  31.3 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  44.19 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  41.03 
 
 		 177 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  28 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>