78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1295 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  94.87 
 
 
197 aa  373  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  74.02 
 
 
204 aa  308  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  37.82 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  38.25 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  43.51 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  37.31 
 
 
204 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  36.84 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  38.31 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  35.8 
 
 
177 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  35.8 
 
 
177 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  39.64 
 
 
335 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  36.02 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  32.95 
 
 
220 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  33.73 
 
 
253 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  34.46 
 
 
177 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  34.36 
 
 
213 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  32.73 
 
 
269 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  35.23 
 
 
177 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  33.87 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  32.72 
 
 
245 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  30.54 
 
 
266 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  33.7 
 
 
209 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  34.07 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  36.46 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  33.15 
 
 
181 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  32.96 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  32.58 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  31.05 
 
 
875 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  32.39 
 
 
183 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  35.85 
 
 
196 aa  85.1  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  29.47 
 
 
187 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  34.24 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  30.58 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  31.19 
 
 
182 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  32.78 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  30.6 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  31.05 
 
 
789 aa  74.7  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  27.36 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  38.46 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  30.1 
 
 
964 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  35.33 
 
 
1297 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  28.42 
 
 
238 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 
1054 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  28.27 
 
 
674 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  26.94 
 
 
776 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  32.41 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  31.46 
 
 
323 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  50.88 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  38.55 
 
 
95 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  33.66 
 
 
290 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  38.55 
 
 
95 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.36 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  31.52 
 
 
787 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  31.85 
 
 
431 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  38.33 
 
 
989 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.36 
 
 
264 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  25.7 
 
 
367 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  32.43 
 
 
311 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  40.74 
 
 
588 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  27.69 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  26.79 
 
 
236 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  29.91 
 
 
384 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  26.92 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  33.75 
 
 
743 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  38.3 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  25.89 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  25.89 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  25.89 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  39.58 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  26.9 
 
 
295 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  34.71 
 
 
245 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  27.08 
 
 
359 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  44.44 
 
 
227 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  42.22 
 
 
227 aa  41.2  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>