69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2746 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  50.86 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  54.73 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  52.6 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.86 
 
 		 264 aa  147  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  48.48 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  48.48 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.86 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  54.05 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  48.3 
 
 		 322 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  41.33 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  44.74 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  41.61 
 
 		 323 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  40.13 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  46.81 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  40.12 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  38.32 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  44.52 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  44 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  43.07 
 
 		 259 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  33.5 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  34.1 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  35.23 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  39.26 
 
 		 238 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  40.51 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  35.85 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  35.85 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  47.66 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  34.07 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  31.95 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  34.24 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  31.98 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  33.14 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  32.09 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  43.24 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  33.73 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  42.06 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  40 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  31.4 
 
 		 335 aa  67.8  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  30.46 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  29.47 
 
 		 776 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  36.28 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  35.58 
 
 		 875 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 1054 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  35.04 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  29.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  43.86 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  34.95 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 		 789 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  28.43 
 
 		 674 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  27.75 
 
 		 964 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  29.91 
 
 		 367 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  27.89 
 
 		 295 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  30 
 
 		 266 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  30 
 
 		 266 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  30 
 
 		 266 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  29.31 
 
 		 431 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  28.66 
 
 		 588 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  29.06 
 
 		 384 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  25.5 
 
 		 359 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  42 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3274  hypothetical protein  31.78 
 
 		 910 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  34.18 
 
 		 787 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  42 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  23.78 
 
 		 296 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  24.16 
 
 		 368 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  24.63 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  29.41 
 
 		 989 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>