45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5336 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  100 
 
 		 368 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  71.47 
 
 		 353 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  67.27 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  57.39 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  63.57 
 
 		 295 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  74.76 
 
 		 296 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  73.33 
 
 		 245 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  65.67 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  68.63 
 
 		 384 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  59.02 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  59.02 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  59.02 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  34.01 
 
 		 709 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  34.91 
 
 		 284 aa  93.6  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  27.27 
 
 		 553 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  27.27 
 
 		 587 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  27.27 
 
 		 587 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  27.27 
 
 		 587 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  27.27 
 
 		 587 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  28.4 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 		 181 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  27.98 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  29.3 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  30.36 
 
 		 181 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  28.4 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  28.4 
 
 		 567 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  31.37 
 
 		 177 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  31.37 
 
 		 177 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  28.36 
 
 		 177 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  27.75 
 
 		 183 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 		 177 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  35.71 
 
 		 181 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  30.19 
 
 		 190 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  30.88 
 
 		 588 aa  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  31.74 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  43.75 
 
 		 208 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 789 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  27.72 
 
 		 204 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  28.4 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  34.91 
 
 		 183 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  27.17 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  29.56 
 
 		 209 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 182 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>