50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0125 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  40.62 
 
 		 177 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  40.13 
 
 		 177 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  37.58 
 
 		 177 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  37.58 
 
 		 177 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  38.65 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  36.41 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  37.65 
 
 		 182 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.83 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  37.75 
 
 		 181 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  35.8 
 
 		 187 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.52 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  35.19 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  32.68 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  30.99 
 
 		 208 aa  72  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  31.87 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  31.03 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  29.86 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  32.19 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  30.85 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  31.38 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  28.42 
 
 		 197 aa  62  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  28.42 
 
 		 197 aa  62  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  28.11 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  26.67 
 
 		 776 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  28.72 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  28.43 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  26.15 
 
 		 674 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  27.51 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  38.83 
 
 		 746 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 		 1054 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 363 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  25.67 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  25.84 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  27.87 
 
 		 964 aa  49.7  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  26.07 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  26.29 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  23.12 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  34 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  27.22 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  24.6 
 
 		 335 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  25.91 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3274  hypothetical protein  24.54 
 
 		 910 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14902  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  31.9 
 
 		 875 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  28.7 
 
 		 204 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>