48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1484 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  100 
 
 
323 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  52.76 
 
 
322 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  57.84 
 
 
259 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.41 
 
 
264 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.44 
 
 
264 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  42.11 
 
 
183 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  45.45 
 
 
181 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  42.38 
 
 
177 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  42.38 
 
 
177 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  42 
 
 
177 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  41.06 
 
 
177 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  41.61 
 
 
196 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  38.73 
 
 
181 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  36.61 
 
 
187 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  39.47 
 
 
183 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
182 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
189 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  38.56 
 
 
181 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  30.48 
 
 
208 aa  86.7  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  33.67 
 
 
207 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  34.81 
 
 
190 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  35.76 
 
 
187 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  31.03 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  28.97 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  30.73 
 
 
212 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  28.72 
 
 
204 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  26.73 
 
 
875 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 
220 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  31.46 
 
 
197 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  31.46 
 
 
197 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  25.52 
 
 
197 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  29.59 
 
 
204 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  23.85 
 
 
674 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  29.67 
 
 
209 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  29.08 
 
 
204 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  34.21 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  28.64 
 
 
204 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  27.23 
 
 
203 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  33.05 
 
 
209 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  25.56 
 
 
204 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  31.12 
 
 
220 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  23.36 
 
 
776 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  29.41 
 
 
743 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  30.35 
 
 
213 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  28.81 
 
 
266 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  28 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  32.77 
 
 
789 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  29.38 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>