61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0773 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  91.39 
 
 		 209 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  77.51 
 
 		 209 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  47.14 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  50.7 
 
 		 187 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  52.4 
 
 		 181 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  47.85 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  43.96 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  47.85 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  49.52 
 
 		 181 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  49.76 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  46.89 
 
 		 177 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  42.79 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  45.45 
 
 		 177 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  45.83 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  45.15 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  41.18 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  45.24 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  45.03 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  43.55 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  42.71 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  42.06 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  41.75 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  41.97 
 
 		 204 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  42 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  37.44 
 
 		 190 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  36.32 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  34.43 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 		 789 aa  95.9  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  29.58 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  33.82 
 
 		 266 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  35.07 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  36.2 
 
 		 269 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  34.27 
 
 		 253 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  55.66 
 
 		 286 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  30.6 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  30.6 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  30.43 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  36.11 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  26.51 
 
 		 875 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  30.62 
 
 		 674 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  33.14 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  42.06 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.4 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  28.72 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.4 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  32.8 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  44.74 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  44 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  33.33 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  27.2 
 
 		 743 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  39.76 
 
 		 95 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  32 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  38.55 
 
 		 95 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  33.6 
 
 		 787 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  34.43 
 
 		 1297 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  27.1 
 
 		 776 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  27.09 
 
 		 368 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  30.97 
 
 		 588 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 1054 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  26.11 
 
 		 353 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>