55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3040 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  47.31 
 
 		 190 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  49.43 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  44.69 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  44.69 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  40.84 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  43.01 
 
 		 177 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  41.57 
 
 		 177 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  43.33 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  40.13 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  37.63 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  35.42 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  35.45 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  38.3 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  36.92 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  33.33 
 
 		 212 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  35.96 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  37.26 
 
 		 209 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  29.47 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  29.47 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  35.76 
 
 		 323 aa  84.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  29.79 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  36.13 
 
 		 322 aa  81.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  34.11 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  30.27 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  29.25 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  26.42 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.76 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  28.77 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  29.25 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  28.3 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  29.85 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  37.12 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  29.74 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  25.77 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 		 789 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  37.35 
 
 		 1297 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  30.5 
 
 		 875 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  26.32 
 
 		 674 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 		 1054 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  26.49 
 
 		 253 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  34.41 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  28.07 
 
 		 335 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  28.39 
 
 		 245 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  24.88 
 
 		 776 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  30.33 
 
 		 787 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  26.32 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  29.46 
 
 		 964 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  27.92 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  28.81 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  27.94 
 
 		 296 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>