More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2261 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  100 
 
 		 787 aa  1621    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  66.4 
 
 		 789 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  52.53 
 
 		 1297 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3274  hypothetical protein  43.82 
 
 		 910 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  30.96 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  31.52 
 
 		 674 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  30.59 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  29.38 
 
 		 582 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  34.97 
 
 		 204 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  33.33 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  33.59 
 
 		 274 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  35.48 
 
 		 204 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  30.08 
 
 		 751 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  33.54 
 
 		 204 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  25.79 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  30.71 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  31.45 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  28.57 
 
 		 776 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  31.82 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  31.82 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  31.09 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  29.27 
 
 		 727 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  29.27 
 
 		 727 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  35.81 
 
 		 212 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  29.86 
 
 		 352 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  25.4 
 
 		 319 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  31.09 
 
 		 300 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  31.67 
 
 		 323 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.93 
 
 		 343 aa  55.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  28.68 
 
 		 390 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  25.13 
 
 		 414 aa  55.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.47 
 
 		 321 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  30 
 
 		 291 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.73 
 
 		 376 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  39.36 
 
 		 189 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  32.5 
 
 		 444 aa  55.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  28.36 
 
 		 340 aa  54.7  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 		 177 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  23.67 
 
 		 302 aa  54.7  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  27.45 
 
 		 402 aa  54.7  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  26.19 
 
 		 446 aa  54.7  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  32.67 
 
 		 209 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  31.2 
 
 		 443 aa  54.7  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  34.48 
 
 		 177 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  34.48 
 
 		 177 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  25.4 
 
 		 327 aa  54.3  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  27.23 
 
 		 308 aa  54.3  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  29.77 
 
 		 284 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  37.18 
 
 		 177 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  25.81 
 
 		 392 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  44.78 
 
 		 220 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  29.41 
 
 		 251 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  27.42 
 
 		 391 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  31.52 
 
 		 197 aa  53.9  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  26.61 
 
 		 392 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  31.52 
 
 		 197 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  25.95 
 
 		 529 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  28.15 
 
 		 320 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.03 
 
 		 326 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  31.09 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  29.41 
 
 		 285 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  31.52 
 
 		 197 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  25 
 
 		 414 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  27.53 
 
 		 332 aa  52.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  27.2 
 
 		 198 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  29.69 
 
 		 340 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  30 
 
 		 379 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  26.87 
 
 		 294 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  32.03 
 
 		 439 aa  52.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  27.2 
 
 		 198 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  29.69 
 
 		 340 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  32.81 
 
 		 446 aa  52.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  33.6 
 
 		 209 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  30.49 
 
 		 743 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0260  peptidoglycan hydrolase  27.33 
 
 		 316 aa  52.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  30.65 
 
 		 382 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  30.95 
 
 		 440 aa  52  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0267  peptidoglycan hydrolase  27.33 
 
 		 316 aa  52.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  30.95 
 
 		 204 aa  52  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  25.13 
 
 		 330 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  28.33 
 
 		 354 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  26.87 
 
 		 292 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  27.2 
 
 		 293 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28 
 
 		 303 aa  51.6  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  24.85 
 
 		 273 aa  52  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  25.62 
 
 		 457 aa  51.6  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  25.62 
 
 		 457 aa  51.6  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  27.48 
 
 		 271 aa  52  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  31.06 
 
 		 288 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  51.16 
 
 		 248 aa  51.6  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  29.55 
 
 		 446 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  41.46 
 
 		 253 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  29.93 
 
 		 198 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  28.91 
 
 		 339 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  28.23 
 
 		 231 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  27.61 
 
 		 450 aa  50.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  27.5 
 
 		 324 aa  50.8  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  27.41 
 
 		 305 aa  50.8  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  31.09 
 
 		 274 aa  50.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>